python读取文件对各列进行索引 可以用readlines, 也可以用readline, 如果是大文件一般就用readline
d={}a_in = open("testfile.txt", "r")for line in a_in: columnssplit = line.rstrip().split("\t") d[columnssplit[0]]=columnssplit[1]a_in.close()ID_test = open("correlation.txt", "r")for line in ID_test: s = line.rstrip().split("\t") if s[1] in d: print s[0]+"\t"+d[s[1]]ID_test.close()## Here is another examplef = open("test.txt", "r") while True: line = f.readline() if line: # 或者用 if line != "": print line else: break f.close()
参考:
python 还有一个pandas 主要用于大数据分析, 它与matplotlib以及 numpy 结合可以替代R语言进行统计学分析, 获取dataframe的 各行内容,可以用iterrows() 和 itertuples(), 其中 itertuples() 比 iterrows()速度更快。
import pandas as pddf1 = pd.read_csv("test.txt", header = None, sep='\t')# 打印前三行print df1[:3]# 选取前三行的 前三列, 使用df.locdf2 = df1.loc[:3, [0, 1, 2]]print df2# 替换第三列的部分内容col3 = df2.apply(lambda r: r[2].replace("KH","TF"), axis=1)# 合并第一列和替换后的第三列内容df3 = pd.concat([df2[0], col3], axis = 1)print df3
参考: